Абберативный: Аберрантный | это… Что такое Аберрантный?

Картирование сайта связывания гепарина гремлина, антагониста BMP, с помощью сайт-направленного мутагенеза на основе прогностического моделирования

. 2015 15 августа; 470(1):53-64.

дои: 10.1042/BJ20150228. Epub 2015 11 июня.

Арнольд Джуниор Тацинкам 1 , Барбара Маллой 1 , Кристофер Си Райдер 1

принадлежность

  • 1 Центр биомедицинских наук, Королевский университет Холлоуэя в Лондоне, Эгам-Хилл, Эгам, Суррей TW20 0EX, Великобритания
  • PMID: 26251446
  • DOI: 10.
    1042/БДЖ20150228

Арнольд Младший Тацинкам и др. Биохим Дж. .

. 2015 15 августа; 470(1):53-64.

дои: 10.1042/BJ20150228. Epub 2015 11 июня.

Авторы

Арнольд Джуниор Тацинкам 1 , Барбара Маллой 1 , Кристофер Си Райдер 1

принадлежность

  • 1 Центр биомедицинских наук, Королевский университет Холлоуэя в Лондоне, Эгам-Хилл, Эгам, Суррей TW20 0EX, Великобритания
  • PMID: 26251446
  • DOI: 10. 1042/БДЖ20150228

Абстрактный

Гремлин является членом семейства CAN (cerberus и DAN) секретируемых антагонистов BMP (костный морфогенетический белок), а также агонистом рецептора-2 VEGF (фактор роста эндотелия сосудов). Он имеет решающее значение для развития скелета конечностей и почек и повторно экспрессируется при фиброзе тканей. Гремлин прочно связывается с гепарином и гепарансульфатом, и в настоящем исследовании мы стремились исследовать его сайт связывания с гепарином. Чтобы исследовать предполагаемый несмежный сайт связывания, предсказанный с помощью компьютерного молекулярного моделирования, мы заменили в общей сложности 11 ключевых аргининов и лизинов, расположенных в трех основных кластерах последовательностей остатков, гомологичными последовательностями из cerberus и DAN (дифференциальный скрининг выбранных генных абберативных в нейробластоме) , CAN-белки, в которых отсутствуют основные остатки в этих положениях.

Панель из шести меченных Myc мутантов гремлина, MGR-1-MGR-6 (MGR, мутантный гремлин), каждый из которых содержит различные комбинации целевых замен, показала заметно сниженную аффинность к гепарину, что продемонстрировано их элюированием NaCl на гепариновой аффинной хроматографии, тем самым подтверждая наши прогнозы. Как MGR-5, так и MGR-6 сохраняли активность связывания BMP-4, сравнимую с активностью гремлина дикого типа. Низкомолекулярный гепарин не способствовал и не ингибировал связывание BMP-4. Наконец, поперечное связывание глутаральдегида продемонстрировало, что гремлин образует нековалентные димеры, поведение которых сходно с поведением DAN, а также PRDC (белок, родственный церберу и DAN), другому белку CAN. Полученный димер будет иметь два сайта связывания гепарина, каждый из которых проходит вдоль открытой поверхности на второй петле пальца β-цепи одного из мономеров.

Ключевые слова: семейство CAN; костный морфогенетический белок; антагонист костного морфогенетического белка; гремлин; гепарансульфат; гепарин.

© 2015 Авторы; опубликовано Portland Press Limited.

Похожие статьи

  • Связывание антагониста костного морфогенетического белка гремлина с почечным гепарансульфатом: такое связывание не является существенным для антагонизма BMP.

    Тацинкам А.Дж., Рун Н., Смит Дж., Норман Дж.Т., Маллой Б., Райдер К.С. Тацинкам А.Дж. и соавт. Int J Biochem Cell Biol. 2017 фев;83:39-46. doi: 10.1016/j.biocel.2016.12.006. Epub 2016 12 декабря. Int J Biochem Cell Biol. 2017. PMID: 27979781

  • Анализ и идентификация мотива связывания гепарина/гепарансульфата Grem2.

    Каттамури С., Нолан К., Томпсон Т.Б. Каттамури С. и др. Биохим Дж. 8 марта 2017 г .; 474 (7): 1093-1107. DOI: 10.1042/BCJ20161050. Биохим Дж. 2017. PMID: 28104757 Бесплатная статья ЧВК.

  • Структура супрессора нейробластомы туморогенности 1 (NBL1): понимание функциональной изменчивости антагонистов костного морфогенетического белка (BMP).

    Нолан К., Каттамури С., Людеке Д.М., Ангерман Э.Б., Рэнкин С.А., Стивенс М.Л., Зорн А.М., Томпсон Т.Б. Нолан К. и др. Дж. Биол. Хим. 2015 20 фев; 290(8):4759-4771. doi: 10.1074/jbc.M114.628412. Epub 2015 5 января. Дж. Биол. Хим. 2015. PMID: 25561725 Бесплатная статья ЧВК.

  • Костный морфогенетический белок-7 и гремлин: новые терапевтические мишени для диабетической нефропатии.

    Чжан Ю, Чжан Ц. Чжан И и др. Biochem Biophys Res Commun.

    2009 22 мая; 383(1):1-3. doi: 10.1016/j.bbrc.2009.03.086. Epub 2009 19 марта. Biochem Biophys Res Commun. 2009. PMID: 19303394 Обзор.

  • Гремлины: до чего дошел почечный фиброгенез?

    Мерфи М., МакМахон Р., Лаппин Д.В., Брэди Х.Р. Мерфи М. и др. Опыт Нефрол. 2002;10(4):241-4. дои: 10.1159/000063698. Опыт Нефрол. 2002. PMID: 12097827 Обзор.

Посмотреть все похожие статьи

Типы публикаций

термины MeSH

  • 9 0117

вещества

Понимание глубины резкости изображения

by John | определения оптики

Глубина резкости — это диапазон расстояний, при котором оптическое разрешение изображения максимально возможно для данного объектива, т. е. изображение кажется сфокусированным. При запуске программы проектирования линз хорошее понимание физики этого параметра поможет вам и вашему консультанту достичь наилучшего возможного дизайна.

1 «Круг нерезкости» и глубина резкости

2 Ключевая формула

3 Упрощенная формула

4 Альтернативная формула

5 Источники «Круг нерезкости»

5.1 1.) Дифф. фракция

5.2 2.) Аберрации

5.3 3.) Размер пикселя

6 Резюме

В этом видео мы объясняем глубину резкости более подробно.

 

«Круг нерезкости» и глубина резкости

Круг нерезкости 9′2-Fd_c S)

Источники «круга нерезкости»

1.) Дифракция

Дифракционные пределы

• Из-за конечной апертуры оптической системы оптические системы имеют предел дифракционной картины Эйри.

•Диаметр кружка нерезкости соответствует ширине центрального максимума дифракционной картины Эйри.

• Следовательно, d_c=d_Airy

2.) Аберрации

Аберрации

• Остаточные аберрации приводят к размытию изображения точки.

• Остаточные сферические аберрации приводят к разным точкам пересечения лучей, проходящих через разную высоту апертуры. Пересекающиеся лучи образуют каустические поверхности с перетяжкой. Диаметр талии соответствует Кругу нерезкости.

d_c=d_Waist

3.) Размер пикселя

разрешение сенсора

• Все датчики изображения имеют определенный размер пикселя.

•Диаметр кружка нерезкости соответствует размеру пикселя.

Размер в пикселях.

d_c=d_Pix

Конечный размер пикселя приводит к глубине резкости (Df) в пространстве изображения.

Резюме

•Глубина резкости является неотъемлемым свойством реальной оптической системы из-за физических и технологических ограничений.

  – DF зависит от 1-го порядка с F-числом

  – DF зависит от 2-го порядка расстояния до объекта S

• Реальные системы имеют разную коррекцию остаточных аберраций и значение диафрагмы.

alexxlab

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *