Мы хотим, чтобы вы знали ответы на важный вопрос: для чего используется монокль? Это не просто костюмы, у них есть цель.

Монокли используются для увеличения изображений , подобно очкам для чтения. Они добавляют ясности и четкости тексту и изображениям для тех, кто не может видеть предметы вблизи.

Теперь, когда вы знаете, для чего используется монокль, вы можете подумать: почему люди носят монокли? Что ж, иногда очки для чтения требуют слишком много усилий, и вы не можете постоянно носить увеличительные стекла в кармане. Кроме того, если у вас есть монокль, обернутый вокруг шеи, вы сочетаете функциональность и моду в одном!

Если вы когда-нибудь сталкивались с кем-то, у кого есть один из этих уникальных окуляров, вы могли бы задуматься: как работает монокль? Не волнуйтесь, мы ответим на все ваши вопросы об этом старинном заявлении о моде. Так что держитесь там, пока мы объясняем.

На одной стороне круглого диска, который является вашим моноклем, есть две маленькие плоские платформы, называемые галереями. Эти маленькие выступы, благодаря силе тяжести и напряжению, помогают удерживать монокль на лице.

Как только окуляр правильно размещен (что является следующей концепцией, которую мы обрисуем в общих чертах, когда будем инструктировать вас, как надевать монокль), он может остаться включенным в обязательном порядке!

Другой частью работы монокля является цель его ношения, как только вы его наденете. Монокли — это лупы для людей с плохим зрением.

С ними на меньше обязательств, чем с очками , особенно потому, что их можно носить на шее или прикреплять к одежде, а не носить с собой неуклюжие очки. Очень просто!

Далее в этой статье о том, как носить монокль с высоты птичьего полета, мы хотим рассказать вам, как надевать монокль, потому что, если он у вас есть, вам обязательно нужно это знать.

И на этом мы не остановимся. Помимо того, что вам будет удобно надевать его (и держать его там), мы хотим дать несколько советов по стилю, продемонстрировать отличные идеи нарядов и отличные дизайны.

Чтобы вдохновить вас на множество способов выбора и стиля ваших очков, мы хотели предоставить несколько советов и фотографий, чтобы расширить ваш выбор способов ношения монокля. Ниже приведены несколько различных способов раскрыть весь потенциал этих крошечных, но мощных аксессуаров, в зависимости от того, какое модное заявление вы хотите сделать!

Во-первых, это классическое олдскульное изображение монокля — точное изображение, которое вы можете себе представить, думая о великолепном стиле 20-х и 30-х годов.

Ношение этих окуляров в сочетании с официальным нарядом в викторианском стиле — традиционный способ ношения монокля, полностью соответствующий эпохе.

Далее, у вас есть монокли, которые больше похожи на аксессуар, чем на функциональность, но это не значит, что они не могут быть и тем, и другим. В то время как монокли в стиле ар-деко, выполненные вручную, не просто великолепны, они могут сидеть на вашем лице немного менее комфортно, в зависимости от того, как они были изготовлены.

Даже если вы не используете этот аксессуар для очков обычным образом, вы все равно можете использовать его как лупу. Это означает, что вам не нужно носить громоздкое увеличительное стекло в кармане или щуриться, чтобы что-то прочитать. С помощью монокля, висящего на вашем костюме, вы можете легко сфокусироваться на любом мелком тексте.

Поначалу ваши друзья могут насмехаться над вашим выбором очков, но как только они поймут удобство монокля, вы можете вдохновить их пойти и купить себе очки.

Если ваш наряд более нейтральный, вы всегда можете жуж дополнить его эффектным моноклем. Это новый способ добавить неожиданную деталь в свой образ.

Как и в случае с любым модным аксессуаром, вы можете найти совершенно дерзкий, вдохновляющий и удивительный монокль, который не только улучшает зрение, но и стильно дополняет ваш гардероб.

Забудьте о шиньоне или большом ожерелье — вам просто нужен великолепно сделанный монокль, и вы уже в пути.

Конечно, есть монокли, которые предназначены не столько для моды, сколько для того, для чего они были созданы столетия назад — для чтения! Вам не нужно искать стиль, когда вы носите монокль (хотя это может быть желанным побочным эффектом). Вы можете просто быть практичным и модным энтузиастом очков в поисках идеальной линзы.

Наконец, самый очевидный вид монокля — стимпанк. Сейчас это один из самых популярных модных ракурсов. Пока мы говорим, это сильное, мощное и достойное восхищения чувство моды становится все более популярным.

Добавление монокля к вашему викторианскому образу с элементами панка даст вам преимущество над тем, что делают другие люди, чтобы их стиль стимпанк был законченным.

Самые популярные монокли в стиле стимпанк довольно скромные, сделаны из тонкой проволоки и без излишеств цепи. Существуют не только различные металлы для оправ, но и различные цвета для линз, включая зеленый, синий и оранжевый.

Их можно носить как аксессуары к костюму или использовать с настоящими линзами, отпускаемыми по рецепту.

Первое, что вам нужно сделать перед тем, как надеть монокль, это зажать его за маленькие петли на внешней стороне кольца, круг, который прикрепляет ваш монокль к подвесной веревке. .

Затем вам нужно повернуть сторону с галереями лицом вверх к своему лицу. Теперь вы готовы надеть очки на лицо и примерить их.

Следующим шагом перед надеванием монокля является правильная регулировка галерей для обеспечения наиболее удобной посадки. Вы захотите начать с размещения одной из двух галерей на своей скуле и найти полку, на которой будет стоять галерея, не упираясь в глазницу.

Это может показаться очевидным, но это может случиться. Это так же неудобно, как звучит! Не стесняйтесь немного поиграть, чтобы получить идеальное место.

Затем вам нужно поднять бровь, чтобы освободить как можно больше места, чтобы вторая верхняя галерея располагалась под надбровной костью, примерно так, как вы могли бы выглядеть, когда вы супер удивлен.

Еще раз, галерея не должна впиваться в вашу глазницу, она должна использовать естественное напряжение между бровью и скулой, чтобы сидеть удобно.

Вы также должны убедиться, что монокль находится достаточно далеко от глаза, чтобы ваши ресницы не касались линзы, так как это добавит дискомфорта при длительном ношении монокля.

Между размещением и безопасностью вашего монокля, возможно, потребуется немного повозиться, чтобы сделать его как надо.

Теперь вам нужно иметь возможность передвигаться без падения монокля. Вы можете себе представить смущение, если бы это случилось на глазах у всего вашего сверхбогатого элитного круга друзей?

После того, как вы установили монокль и галереи стали удобными и безопасными, вы сможете поворачивать голову из стороны в сторону, вверх и вниз, при этом монокль не будет смещаться, выпадать или тереться о ресницы. Если это так, вам нужно будет отрегулировать его, пока он не будет сидеть правильно.

Если все в порядке, значит, вы справились! Мы гордимся тем, что вы это поняли. Тем не менее, заставить его сидеть и убедиться, что он подходит вашему лицу, — это две разные проблемы.

Если вы столкнулись с этими проблемами, задайте себе несколько вопросов, чтобы убедиться, что она идеально сидит и подходит по размеру для вашего лица.

• Вы сильно щуритесь, чтобы удерживать монокль? Тогда он станет слишком маленьким, и со временем ваши мышцы будут работать на полную мощность, чтобы удерживать этот окуляр. Вам не нужно ходить с сердитым видом, морщась на лбу, чтобы не снимать очки. Вы бы не сделали этого в очках, так что не делайте этого с моноклями! Вам нужно будет увеличить размер.

• Не стягивает ли монокль кожу под глазом там, где видна мясистая часть? Это поднимает вашу бровь выше, чем другой? Это может означать, что монокль слишком большой. Несмотря на то, что он может не выпасть, показ этих уязвимых глазков может быть неудобным через несколько минут — вам нужно уменьшить размер.

Итак, мы рассмотрели, как великолепно может выглядеть монокль. Но важный вопрос, который следует задать себе, помимо того, как носить монокль, заключается в том, как монокль остается на вашем лице, когда вы его носите?

Отличные вопросы, заслуживающие подробного ответа. Мы хотели знать одно и то же, поэтому углубились в кроличью нору этих очков.

Кажется, что все согласны с тем, что первый шаг — это приобрести тот, который подойдет лично вам. Как мы уже говорили, монокли бывают разных размеров — они могут быть слишком большими, слишком маленькими или в самый раз. Если это последний из этих вариантов, он не должен сдвинуться с места, если вы этого не хотите, независимо от того, двигаетесь ли вы, дрожите, наклоняетесь или занимаетесь своей повседневной жизнью.

Ключом к любому хорошо расположенному моноклею, который не отрывается от лица, являются галереи в верхней и нижней части окуляра. Если каждый из них находится там, где он должен быть (на надбровной кости и скуле), монокль должен оставаться включенным из-за естественного напряжения вашей кожи. Как только вы привыкнете идеально наносить его на лицо, остальное станет историей!

Если вы прочитали эту статью и теперь задаетесь вопросом: Конечно, это здорово, но где я могу купить монокль? Что ж, мы подумали, что вы спросите, поэтому немного покопались. Если вы ищете монокль, который удовлетворит некоторые творческие потребности, практичные очки или поможет создать законченный модный образ, есть несколько отличных мест, где можно найти монокль:

1. Reading Glass World
2. Nine Life 
3. Amazon
4. Grandado
5. Etsy

Краткий ответ? Так должно быть! Ношение монокля должно (и может) быть таким же удобным, как и любой другой тип традиционных очков. Если вам нужен монокль для улучшения зрения, вы можете подобрать его идеального размера и стиля у большинства поставщиков очков.

Существует множество различных типов очков, соответствующих вашим потребностям, так же, как и обычные очки.

Тем не менее, существует множество роскошных и менее практичных моноклей, которые очень стильны, но немного менее универсальны, когда дело доходит до удобства ношения.

Мы говорим о винтажном стиле или о моде в стиле стимпанк. Если вы собираетесь носить украшение в стиле ар-деко ручной работы на скулах, оно может сидеть не так хорошо, как массовый современный стиль.

К счастью, большинство окуляров поставляются на шнурке или цепочке, что делает вопрос о том, как носить монокль, довольно простым ответом. В качестве универсального аксессуара его можно носить как ожерелье, на лице или на шее, когда вы им не пользуетесь (и если вы хотите носить его как очень милый модный аксессуар).

Это беспроигрышный вариант! Монокли — удобная вещь.

Самый большой вопрос, который вы должны задать себе, это то, что вы хотите делать с этим окуляром и как носить монокль, который попал в ваше распоряжение. Подходит ли он по размеру и подходит ли он вашему лицу? Это из-за моды или функциональности, или того и другого? Тогда вы сможете носить его уместно, удобно и практично, не жертвуя стилем.

Что ж, нам чертовски понравилось копаться в глубоком, красочном и модном мире моноклей. Мы надеемся, что вам понравилось узнавать об этих удивительных и мощных аксессуарах для очков, а также о том, как правильно носить монокль.

Несмотря на интересную историю и одержимость нью-эйдж моноклями, нам пришлось задаться вопросом, будем ли мы носить их?

Изучая их наследие и то, как их носят, можно с уверенностью сказать, что мы были чрезвычайно впечатлены тем, насколько настойчивым и управляемым остается искусство ношения монокля во все времена.

Если он не сломан, не чините его, и это, безусловно, относится к этим окулярам. Они практичные, крошечные и крутые, вот и все.

Если вы задаетесь вопросом, предпочитаете ли вы носить с собой монокль на шее, очки для чтения или увеличительное стекло, мы думаем, что знаем ответ.

Имеет смысл выбрать монокль, независимо от того, будет ли это украшение ручной работы, винтажная мода или украшение! Монокли имеют больше смысла.

Окончательный вердикт о том, стоит ли носить монокль? Черт, да. Возможно, у нас еще нет монокля, но если есть что-то, что сделал этот обзор, так это то, что он нас вдохновил.

Желаете ли вы лучше видеть, меньше обременять себя громоздкими окулярами или носить великолепный, винтажный и традиционный аксессуар — здесь нет неправильного ответа. Все хорошо!

Понравилось это руководство? Взгляните на эти другие, мы уверены, что они вам тоже понравятся!

Что надеть на собеседование

Что надеть на летнюю свадьбу

Что надеть в спортзал

Что надеть в церковь

Получите доступ к эксклюзивным предложениям

Подпишитесь бесплатно, чтобы получать эксклюзивные предложения на свой почтовый ящик. 100% конфиденциальность

Building Monocle, универсальный персональный поисковик на всю жизнь

Monocle — это система полнотекстового поиска, которая индексирует мои личные данные, такие как сообщения в блогах и эссе, почти десятилетние записи в журналах, заметки, контакты, твиты и, надеюсь, что-то еще в будущем, например, электронные письма и историю просмотра веб-страниц. Это позволяет мне запросить весь этот набор данных, чтобы найти все, что я видел или о чем писал раньше, и действует как настоящая «расширенная память» на всю мою жизнь.

Как только он был запущен, Monocle быстро заменил поле поиска почти во всех других приложениях, которые я использую, и стал первым и единственным местом, где я искал информацию, которую, как я знал, я видел раньше. Искал ли я кого-то, с кем встречался раньше, новую идею для блога или заметку о том, как что-то сделать с помощью JavaScript — у Monocle было все это, и я получил его менее чем за 5 секунд из любого места на моем компьютере.

Это история о том, как работает Монокль, как я его собрал за выходные и как я им пользуюсь.

Универсальная поисковая система

Идея Monocle впервые пришла мне в голову почти ровно год назад, когда я написал в Твиттере о возможном создании поисковой системы, которая ищет только мои личные и личные данные.

Думая о создании «персональной поисковой системы»

Поисковая система, которая индексирует только мой блог, мои твиты, мой журнал, мой календарь/электронную почту и контакты, мои фотографии и историю браузера.

Я хочу иметь лучшую память без необходимости запоминать больше материала. Что еще он должен индексировать?

— Линус (@thesephist) 13 июля 2020 г.

С тех пор я несколько раз думал о реализации этой идеи, но каждый раз меня отвлекала или пугала потенциальная сложность проекта. Затем около недели назад, когда я писал о постепенном ведении заметок, я понял, что эффективное запоминание информации имеет решающее значение для хорошего инструмента личных знаний. Это возродило мой интерес к этому проекту. В прошлые выходные я воспользовался этой идеей и создал первый прототип с помощью Ink, изучая в процессе основы алгоритмов полнотекстового поиска.

Основное описание Monocle состоит в том, что это полнотекстовая поисковая система, индексирующая только мои личные данные. Я объяснил технические детали ее архитектуры в репозитории GitHub, где размещен код. Здесь я хочу сосредоточиться на нескольких конкретных дизайнерских решениях, которые я принял при разработке Monocle, чтобы сделать его максимально полезным в моих личных рабочих процессах.

Во-первых, Я хотел, чтобы время от Monocle до первого результата было как можно меньше. Под этим я подразумеваю, что наиболее важным показателем успеха для инструмента поиска является то, как быстро я могу перейти от какого-то неясного вопроса, который у меня в голове, к просмотру результатов, чтобы найти то, что мне нужно.

Одним из критических ограничений, которые это накладывало на дизайн Monocle, было то, что мне нужно было иметь возможность искать по мере ввода, чтобы результаты появлялись при каждом нажатии клавиши. Создание множества небольших быстрых инструментов научило меня тому, что часто мгновенное создание чего-то не только делает инструмент более эффективным, но и меняет способ его использования. В этом случае я считаю, что поиск по мере ввода означает, что процесс поиска становится не столько медленным циклом вопросов и ответов, сколько интерактивным исследованием моей базы знаний, когда я печатаю несколько слов, чтобы увидеть, какая информация у меня есть, возможно, удаляя некоторые символы и повторный ввод. Чтобы сделать это возможным, Monocle загружает сжатый предварительно сгенерированный индекс своего набора данных документов при запуске и выполняет весь поиск локально в браузере.

Как и многие другие мои инструменты, ограничение скорости также означало, что я хотел иметь возможность использовать приложение полностью с помощью клавиатуры. Действия критического пути в Monocle — поиск, прокрутка списка результатов и их предварительный просмотр — выполняются одним нажатием клавиши. Все эти дизайнерские решения вместе приводят к инструменту поиска, который почти всегда может помочь мне найти то, что я ищу, за пять секунд из любого места на моем компьютере.

Во-вторых, Мне нужен индексатор и алгоритм поиска, которыми я владею и которые я понимаю. Это отчасти потому, что я просто хотел узнать и понять, как работают полнотекстовые поисковые системы, и часто я учусь, создавая инструменты для себя, используя эти знания. Еще одно преимущество полностью индивидуального алгоритма поиска с нуля заключается в том, что если я понимаю всю систему, я могу знать о ее ограничениях и вернуться, чтобы улучшить ее, когда мне нужно улучшить алгоритм. «Алгоритм поиска» на самом деле состоит из нескольких разных частей:

1. индексатор, каталогизирующий ключевые слова в проиндексированных документах
2. средство поиска, которое считывает документы из индекса, чтобы найти совпадающие результаты
3. стеммер, который расширяет поисковые запросы, включая такие варианты слов, как «инструмент» на «инструменты» или «создать» на «создание»
4. ранжировщик, отвечающий за упорядочивание результатов поиска по некоторому показателю релевантности.

В будущем, если я захочу добавить дополнительные правила индексирования или запросов для категоризации результатов по их типу источника или дате или иметь другую пользовательскую логику, связанную с моими данными, понимание моей собственной системы даст мне преимущество перед использованием чего-то заранее сделанный. Более того, использование чего-то настолько сложного, насколько это необходимо для моих нужд, означает меньше возможностей для взлома алгоритма и большую техническую гибкость. Например, во время разработки мне пришлось переместить индексатор с клиента на сервер, и моя текущая архитектура превратила эту задачу в не более чем копирование и вставку нескольких строк кода.

Мне было очень весело создавать систему полнотекстового поиска и писать собственные модули для каждого из моих источников данных, но лежащая в основе технология никоим образом не является передовой — это просто алгоритм полнотекстового поиска. Магия, как и во многих моих проектах, заключается в том, что возможно, когда вы применяете такие технологии к интересным данным в небольшом хорошо известном стеке, который я контролирую.

О конфиденциальности и праве собственности

Когда я раньше писал о ценности владения, я писал о владении личными данными:

Есть еще одно преимущество владения программными сервисами, которые управляют моей жизнью. Без сомнения, самое ценное, что у меня есть в эти дни, — это мои данные. Мой архив заметок, документов, фотографий и музыки, списки дел, контакты, календари — все это в совокупности составляет мой внешний мозг и мою личность, а это последнее, что я хочу потерять. Я хочу владеть такими данными настолько полно, насколько это возможно физически. Хранить их через онлайн-сервисы или приложения удобно, но я никогда не знаю, когда стороннее приложение для заметок исчерпает финансирование и закроется, или если список дел или музыкальное приложение, которое я использую, перестанет заботиться обо мне как о пользователе. В наши дни почти все данные, которыми я владею, хранятся и резервируются в службах и системах, которыми я управляю, начиная с операционной системы.

Когда я добавил многие из этих источников данных в Monocle, я понял, что многие части того, что делает Monocle особенным, возможны только потому, что я владею своими данными и программным стеком в такой глубокой степени.

Во-первых, Monocle индексирует некоторые очень личные и личные данные, такие как мои записи в дневнике. Если бы Monocle был каким-то сторонним сервисом от подающего надежды стартапа, мои записи в журнале были бы последней вещью, от которой я бы хотел отказаться. Но поскольку я владею и понимаю весь стек поиска, Я чувствую себя в безопасности, позволяя Monocle индексировать такие личные данные . Как следствие, результаты поиска, которые я могу получить, являются более личными и важными, чем любые существующие поисковые программы, которые могли бы найти для меня.

Во-вторых, поскольку я владею всем своим стеком данных, я могу быть уверенным в том, где хранится большая часть моих данных, таких как контакты, заметки и архивные журналы , и в каком формате они сохраняются. Это означает, что писать и поддерживать модули для приема и индексации этих источников данных довольно просто. Мне не нужно беспокоиться о том, что эти источники данных исчезнут или эти источники изменят формат экспорта данных. Я просто общаюсь со своей системой хранения файлов и получаю именно те файлы, которые мне нужны. Я чувствую, что наличие моего стека для большей части данных, которые мне нужно было индексировать, сделало эту проблему намного более разрешимой.

Отчет об опыте, на данный момент

работает всего несколько дней — для меня он вышел в эфир в субботу, а я пишу это в следующий вторник. Но за это время, думаю, я искал в Monocle не меньше раз, чем в Google. С точки зрения того, как часто я собираюсь использовать инструмент, который я создал, Monocle входит в пятерку лучших инвестиций моего времени во всех моих побочных проектах.

За эти несколько дней, вот несколько вещей, которые я искал в Монокле.

• Несколько конкретных людей, которых я встречал раньше, но плохо запомнил
• Темы, о которых я писал ранее, чтобы найти ссылки на сообщения в блогах, которыми я мог бы поделиться
• Несколько компаний и проектов, о которых я слышал раньше, но не знал откуда
• Книги с рекомендациями, которые я припрятал в разных местах своей цифровой жизни
• Несколько тем в Твиттере, которыми я уже делился ранее, о создании побочных проектов и сообществ

Когда я хочу узнать что-то новое , я все равно ищу в Интернете. Но если я пытаюсь вспомнить что-то из своего прошлого, я сразу обращаюсь к Моноклю, потому что это более эффективная и мощная «расширенная память», чем любая система ведения заметок, которую я когда-либо использовал — мне не нужно ввести или явно сохранить что-либо; если я когда-либо записывал это где-то, то это здесь, проиндексированное Моноклем.

Короче говоря, монокль — это самая близкая вещь, которую я когда-либо испытывал, к Memex 9 Ванневара Буша.0010 . Чем больше я его использую, тем больше я хочу, чтобы он становился еще более мощным и еще больше присутствовал в моей жизни. И поскольку я владею всем стеком, я могу делать это без страха, не беспокоясь о конфиденциальности данных. В ближайшие недели и месяцы я надеюсь проиндексировать другие источники данных, такие как история браузера, события календаря и, возможно, даже архив электронной почты.

Пока я создавал Monocle, у меня также появилось более тонкое представление о создании собственных инструментов. Монокль — не самостоятельный проект, а сквозной 9Инфраструктурный проект 0077 , который интегрируется с широким спектром других проектов в моем портфолио, чтобы обеспечить некоторые общие функции: поиск. Это мой второй подобный проект после Noct, который предоставляет общее хранилище и уровень резервного копирования данных для многих моих приложений. После создания Noct резервное копирование и синхронизация файлов больше не были проблемой, которую мне приходилось решать для каждого нового проекта. После Монокля кажется, что поиск также стал чем-то, к чему мне больше никогда не придется обращаться для каждого отдельного проекта. Эти проблемы повсеместно решаются с помощью инфраструктурных проектов, поверх которых могут быть интегрированы отдельные приложения.

Мне нравится эта идея создания частей надежной общей инфраструктуры для сквозных задач в моих личных инструментах. Это немного похоже на создание моей личной облачной платформы, где я могу создавать небольшие приложения, которые интегрируются с Monocle и Noct и другими частями инфраструктуры, и получать эти дополнительные общие функции «бесплатно». В некотором смысле создание собственного языка программирования и среды пользовательского интерфейса дает мне те же преимущества, что и общая инфраструктура. Естественным следующим шагом в этом направлении является создание других общих частей инфраструктуры, таких как универсальный уровень аутентификации. «Персональное облако» звучит амбициозно и грандиозно, но на самом деле кажется, что я собираю здесь правильные элементарные элементы, чтобы двигаться к этому видению.

Записывая и размышляя обо всех этих идеях о личной информации и отзыве, я также знаю, что принадлежу к исчезающему меньшинству людей на Земле, чьи цифровые данные сохранены и организованы достаточно хорошо, чтобы создать такой инструмент, как Монокль. Для большинства людей их важная информация хранится в таком множестве различных частей программного обеспечения в целом ряде компаний и технологий, что создание персонального мемекса кажется невозможным. Помимо того, что я создаю что-то полезное для себя, я также хочу, чтобы Монокль служил своего рода доказательством концепции — часть заявления , возможно, о том, что возможно, когда мы создаем наши собственные инструменты и управляем нашей собственной информацией. Возможно, со знанием того, что возможно, мы сможем подтолкнуть себя к тому, чтобы приблизить то, что мы имеем сегодня, к тому, где мы должны быть: вселенную небольших личных инструментов, которые могут уважать нашу конфиденциальность и свободу действий, используя их, чтобы помочь нам увидеть мир в новом свете. легкий.

← Создание заметок в дикой природе: жизнь с Surface Duo

Генеративная библиотека →

Я делюсь новыми сообщениями в своей рассылке. Если вам понравился этот, вы должны подумать о присоединении к списку.

Есть комментарий или ответ? Вы можете написать мне по электронной почте.

Monocle 3

Начало работы с Monocle 3

Краткий обзор шагов рабочего процесса

Ниже вы можете увидеть фрагменты кода, которые выделяют основные этапы Монокль 3. Нажмите на заголовки разделов, чтобы перейти к подробным разделам. описывая каждый из них и позволяя вам попробовать шаги на примерах данных.

Сохранение данных в объекте cell_data_set

Первым шагом в работе с Monocle 3 является загрузка ваших данных в Основной класс Monocle 3, cell_data_set :

 cds <- new_cell_data_set(expression_matrix,
                         ячейка_метаданные = ячейка_метаданные,
                         ген_метаданные = ген_аннотация)
## Шаг 1: Нормализация и предварительная обработка данных
cds <- preprocess_cds(cds, num_dim = 100) 

Необязательно Удалить пакетные эффекты

Вы можете вычесть неотслеживаемые пакетные эффекты или выровнять ячейки из похожих (но не совсем) одинаковых условий, используя несколько разных методов в Monocle 3.

 ## Шаг 2. Удаление пакетных эффектов с выравниванием ячеек
cds <- align_cds(cds,align_group="batch") 

Кластеризация ячеек

Вы можете легко сгруппировать свои ячейки, чтобы найти новые типы:

 ## Шаг 3: Уменьшите размеры с помощью UMAP
cds <- уменьшить_размер(cds)
## Шаг 4: Кластеризация ячеек
cds <- cluster_cells(cds) 

Необязательный Порядок ячеек в псевдовремени вдоль траектории

Теперь упорядочите свои клетки по тому, насколько они продвинулись через что бы то ни было. процесс, который вы изучаете, такой как дифференцировка, перепрограммирование или иммунный отклик.

 ## Шаг 5. Изучите график
cds <-learn_graph(cds)
## Шаг 6: Порядок ячеек
cds <- order_cells(cds)
plot_cells(cds) 

Дополнительно Выполнение анализа дифференциальной экспрессии

Сравните группы клеток множеством способов, чтобы найти гены с различной экспрессией. управление пакетными эффектами и обработками по своему усмотрению:

 # С регрессией:
Gene_fits <- fit_models (cds, model_formula_str = "~embryo.time")
fit_coefs <- таблица_коэффициентов (gene_fits)
emb_time_terms <- fit_coefs %>% filter(term == "embryo.time")
emb_time_terms <- emb_time_terms %>% mutate(q_value = p.adjust(p_value))
sig_genes <- emb_time_terms %>% filter (q_value < 0,05) %>% pull(gene_short_name)
# С автокорреляцией графика:
pr_test_res <- graph_test(cds, Neighbor_graph="principal_graph", ядер=4)
pr_deg_ids <- row. names (подмножество (pr_test_res, q_value < 0,05)) 

Начало работы

Загрузка библиотеки Monocle 3

 (monocle3)
# В учебнике, показанном ниже и на последующих страницах, используются два дополнительных пакета:
библиотека (ggplot2)
библиотека (dplyr) 

Загрузка ваших данных

Монокль 3 принимает в качестве входных данных ячейку по матрице экспрессии генов. Монокль 3 разработан для использования с абсолютным количеством транскриптов (например, из экспериментов UMI). Монокль 3 работает «из коробки» с матрицами подсчета транскриптов, созданными Сотовый Рейнджер, конвейер программного обеспечения для анализа экспериментов 10X Genomics Chromium инструмент. Monocle 3 также хорошо работает с данными из других рабочих процессов RNA-Seq. такие как sci-RNA-Seq и такие инструменты, как Biorad ddSEQ.

Класс cell_data_set

Монокль содержит данные об экспрессии одной клетки в объектах класс cell_data_set . Этот класс является производным от класса Bioconductor. Класс SingleCellExperiment , который предоставляет общий интерфейс, знакомый тем, кто анализировал другие одноклеточные эксперименты с Биокондуктором. Класс требует три входных файла:

• expression_matrix , числовая матрица значений выражений, где строки — гены, а столбцы — клетки
• cell_metadata , фрейм данных, где строки — это ячейки, а столбцы — это атрибуты клеток (такие как тип клеток, условия культивирования, день захватили и др.)
• gene_metadata , фрейм данных, где строки являются признаками (например, гены), а столбцы — атрибуты генов, такие как биотип, содержание gc, и т.п.

Необходимые размеры для входных файлов

Матрица значений выражения должна быть :

• имеют то же количество столбцов, что и cell_metadata . ряды.
• имеют то же количество строк, что и gene_metadata . ряды.

Кроме того:

• имена строк объекта cell_metadata должны соответствовать столбцу имена матрицы выражения.
• имена строк объекта gene_metadata должны совпадать с именами строк матрицы выражений.
• один из столбцов gene_metadata должен быть назван "gene_short_name", которое представляет собой символ гена или простое имя (обычно используется для построения) для каждого гена.

Создать набор ячеек

Вы можете создать новый набор ячеек_данных (CDS) объект следующим образом:

 # Загрузить данные
expression_matrix <- readRDS(url("https://depts. washington.edu:/trapnell-lab/software/monocle3/celegans/data/cao_l2_expression.rds"))
cell_metadata <- readRDS(url("https://depts.washington.edu:/trapnell-lab/software/monocle3/celegans/data/cao_l2_colData.rds"))
Gene_annotation <- readRDS(url("https://depts.washington.edu:/trapnell-lab/software/monocle3/celegans/data/cao_l2_rowData.rds"))
# Сделать объект CDS
cds <- new_cell_data_set(expression_matrix,
                         ячейка_метаданные = ячейка_метаданные,
                         ген_метаданные = ген_аннотация) 

Создание набора данных cell_data_set из выходных данных 10X

Для ввода данных из 10X Genomics Cell Ranger вы можете использовать функция load_cellranger_data :

Примечание: load_cellranger_data принимает аргумент umi_cutoff который определяет, сколько операций чтения должна быть включена в ячейку. По умолчанию установлено значение 100 . Если вы хотите включить все ячейки, установите umi_cutoff на 0.

Чтобы load_cellranger_data нашел правильные файлы, необходимо указать путь к папке, содержащей немодифицированная папка «outs» Cell Ranger. Ваша файловая структура должна выглядеть так: 10x_data/outs/filtered_feature_bc_matrix/ где filtered_feature_bc_matrix содержит файлы features.tsv.gz, barcodes.tsv.gz и matrix.mtx.gz. ( load_cellranger_data также может обрабатывать данные Cell Ranger V2, где «признаки» заменены на «ген» и файлы не сжаты.)

 # Укажите путь к выходу Cell Ranger.
cds <- load_cellranger_data("~/Загрузки/10x_data") 

Кроме того, вы можете использовать load_mm_data для загрузки любых данных в формате MatrixMarket, предоставив файлы матрицы и два файла метаданных (информация о функциях и информация о ячейке). Для получения дополнительной информации запустите ?load_mm_data

 cds <- load_mm_data(mat_path = "~/Downloads/matrix. mtx",
                    feature_anno_path = "~/Загрузки/features.tsv",
                    cell_anno_path = "~/Загрузки/barcodes.tsv") 

Работа с большими наборами данных тысячи клеток и более. По мере совершенствования инструментов и снижения затрат эксперименты будут становиться все масштабнее и сложнее, со многими условиями, контролирует и копирует. Матрица данных экспрессии с 50 000 клеток и измерение каждого из 25 000+ генов в геноме человека может занять много памяти. Однако, поскольку современные протоколы обычно не охватывают все или даже большую часть молекул мРНК в каждой клетке, многие из вхождений матрицы выражений равны нулю. Использование

разреженные матрицы могут помочь вам в работе с огромными наборами данных на обычном компьютере. Обычно мы рекомендуем использовать разреженные матрицы для большинства пользователей, так как это ускоряет многие вычисления даже для наборы данных более скромного размера.

Чтобы работать с вашими данными в разреженном формате, просто предоставьте их Monocle 3 как разреженная матрица из пакета Matrix :

 cds <- new_cell_data_set(as(umi_matrix, "sparseMatrix"),
ячейка_метаданные = ячейка_метаданные,
ген_метаданные = ген_метаданные) 

Не преобразовывайте случайно в плотную матрицу выражений

Результатом ряда конвейеров RNA-Seq, включая Cell Ranger, является уже в формате sparseMatrix (например, MTX). Если это так, вы должны просто пройти его непосредственно в new_cell_data_set без предварительного преобразования его в плотная матрица (через as.matrix() , потому что это может превышать ваш доступная память.

Поддержка разреженной матрицы монокля обеспечивается Пакет Matrix . Другие пакеты разреженных матриц, такие как slam или SparseM не поддерживаются.

Объединение объектов CDS

Если у вас есть несколько объектов CDS, которые вы хотите проанализировать вместе, используйте наш comb_cds . comb_cds берет список объектов CDS и объединяет их в один объект CDS.

 # сделать поддельный объект второго компакт-диска для демонстрации
cds2 <- cds[1:100,]
big_cds <- comb_cds(list(cds, cds2)) 

Опции

keep_all_genes : если TRUE (по умолчанию), все гены сохраняются, даже если они не совпадают между различными CDS. Клетки, не имеющие данного гена в своих CDS, будут быть отмечены как имеющие нулевое выражение. Когда FALSE, только гены, общие для всех CDS будут сохранены.

cell_names_unique : Когда FALSE (по умолчанию), имена ячеек в CDS не считается уникальным, поэтому к каждому имени ячейки добавляется спецификатор CDS.

No related posts.